Si tienes borrar, crear, copiar, mover, … archivos que empiezan por un guión (-), en la terminal tienes que poner un doble guión como parámetro, por ejemplo.
touch -- -archivo
cp -- -archivo -otro_archivo
rm -- -archivoo bien poner la ruta completa al archivo con el que necesitas trabajar.
touch /home/user/Documentos/-archivo
rm ~/Documentos/-archivo